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La commande scp ne préserve pas les liens symboliques ; elle copie la cible du lien symbolique, ce qui peut amener à copier des grandes quantités de données ou faire des boucles lorsque l’on copie des répertoires entre 2 machines par le réseau.

Voici une page expliquant différentes commandes (scp, rsync et ssh+tar) pour transférer des répertoires entre 2 machines.

http://happygiraffe.net/copy-net